V interiéru kostela se zachovalo mnoho historického mobiliáře. Nachází se zde jedenáct gotických oltářů, nejrozměrnější z nich - hlavní oltář, s výškou 18,62 m, je nejvyšším středověkým oltářním celkem na světě. Kromě nich jsou zde monumentální architektury renesančního organu, barokní kazatelny, měšťanských epitafů a náhrobníky i dřevěných lavic levočských měšťanů. K nejstarší výzdobě kostela z období kolem roku 1400 patří nástěnné malby na stěně severní lodi, ve svatyni kostela.
Jižní portál chrámu patří k nejvyspělejším dílem vrcholné gotiky u nás. V chrámovém prostoru stojí skvostná architektura hlavního křídlového oltáře, nejvyššího v celém gotickém světě, který je vrcholným dílem řezbáře Mistra Pavla z Levoče. V předělu oltáře je výjev Poslední večeře, jádro celého oltáře tvoří skříň, ve které jsou monumentální plastiky Madony s dítětem, sv. Jakuba a sv. Jana v nadživotní velikosti. Oltářní křídla jsou zdobeny reliéfy ze života sv. Jakuba a s. Jana, na jejich zadní straně jsou tabulové malby s výjevy umučení Krista. Oltářní architektura je ukončena štítem z fiál, ve kterém jsou vkomponované gotické sochy apoštolů z předešlého oltáře.
Levočský kněz a humanista Jan Henckel podpořil nejen vznik oltáře s. Janův, ale pravděpodobně i první renesanční stavbu města, nadstavbu knihovny farního kostela, která dodnes nese jeho jméno.
Organ a kazatelna vznikaly téměř současně ve dvacátých letech 17. století. O tato díla se zasloužil bohatý levočský měšťan Friedrich Probst. Kazatelna se bez změn zachovala na původním místě. Organ byl postaven na severní straně hlavní lodi a byl dílem krakovského truhláře Hanse Hertela, dánského sochaře - tovaryše Hansa Schmidta a norimberského organára Hanse Hummela. Organ byl až do svého přemístění v roce 1846 největším v celém Uhersku. Ve farním kostele se vzácný cyklus sedmi dobrých skutků milosrdenství a sedmi smrtelných hříchů na nástěnné malbě. Malby, které doprovázejí texty v lidové řeči a ne v latině, byly zaměřeny na laické společenství, které měly vychovávat.
Slovensky
Anglicky
Maďarsky
Německy
