1991
Po zániku KNV sa zriaďovateľom hvezdárne stalo MK SR. V tomto období boli vykonané ďalšie úpravy okolia areálu Vartovky. V rámci už štvrtej rekonštrukcie chatky pribudla malá miestnosť, ktorá slúži ako sklad a predajňa astronomických a metodických materiálov.
1995
Započala výstavba druhej kopule hvezdárne. Hvezdáreň pokračuje i naďalej vo svojej predošlej činnosti v stredoslovenskom regióne za úzkej spolupráce a koordinácie činností s hvezdárňami v Rimavskej Sobote, Žiari nad Hronom, Žiline a Kysuckom Novom Meste.
1996
Zriaďovateľom hvezdárne sa stáva Krajský úrad v Banskej Bystrici. Organizácia dostáva štatút Krajskej hvezdárne v Banskej Bystrici a jej organizačnými zložkami sa stávajú: Hvezdáreň v Rimavskej Sobote a Hvezdáreň a planetárium M. Hella v Žiari nad Hronom.